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FUSEは仮想ファイルシステムを書くために特に有用である。ディスクに対してデータを読み書きすることを基本とした伝統的なファイルシステムとは異なり、仮想ファイルシステムは実際にデータをファイルシステムに保存しない。それらは既存のファイルシステムやストレージデバイスのビューや翻訳として振舞う。